О направлении
Проводит научные исследования в области методов компьютерного моделирования структур и взаимодействий биологических макромолекул и низкомолекулярных агентов, создает методы направленного дизайна белковых молекул с заданными структурой и свойствами, создает оригинальные динамические модели для описания фармакокинетики и фармакодинамики оригинальных таргетных лекарственных средств, разрабатывает новые методы анализа для геномного и транскриптомного секвенирования.
Руководитель
Федор Анатольевич Колпаков
Кандидат биологических наук, руководитель направления «Вычислительная биология» Университета «Сириус», заведующий лабораторией биоинформатики ФИЦ Информационных и вычислительных технологий, технический директор ООО «Биософт.Ру». Соавтор более 150 публикаций, включая журналы Nature Biotechnology, Nature Communications, Nucleic Acids Research, Bioinformatics, индекс Хирша 18 (Scopus). Под его руководством разрабатывается крупнейшая в мире база данных по регуляции транскрипции – GTRD (Gene Transcription Database) и платформа для моделирования сложных биологических систем и анализа биомедицинских данных BioUML, которая по ряду показателей является лучшей в мире. Также им была разработана концепция построения цифрового двойника пациента и была показана эффективность предложенного подхода на примере прогнозирования лекарственной терапии артериальной гипертонии.
Направления исследований
- исследования в области методов компьютерного моделирования структур и взаимодействий биологических макромолекул и низкомолекулярных агентов;
- создание методов направленного дизайна белковых молекул с заданными структурой и свойствами;
- создание оригинальных динамических моделей для описания фармакокинетики и фармакодинамики оригинальных таргетных лекарственных средств;
- разработка новых методов анализа для геномного и транскриптомного секвенирования млекопитающих и микробиоты;
- проведение образовательных мероприятий в области методов моделирования молекулярных взаимодействий, виртуального скрининга терапевтических агентов, стратегий компьютерной разработки новых лекарственных препаратов.
Проект направления
Разработка конвейера функционального анализа омиксных данных с использованием сравнительной геномики и методов обработки естественного языка.
