Молекулярная биология

Аспирантура

Молекулярная биология

Научная специальность 1.5.3

Образовательная программа направлена на подготовку высококвалифицированных специалистов – исследователей и преподавателей с углубленными знаниями и практически применимыми навыками в области молекулярной биологии.  

Обучающиеся по научной специальности «Молекулярная биология» участвуют в научных исследованиях в области совершенствования технологий создания рекомбинантных вирусных векторов, создании прототипов биологических продуктов для лечения тяжелых хронических заболеваний с высоким потенциалом коммерциализации, разработке новых подходов к созданию лекарственных препаратов для медицинского и ветеринарного применения на основе рекомбинантных белков и малых молекул.

Научно-исследовательская деятельность направления сфокусирована на вопросах дизайна и оптимизации новых молекул, медицинской химии, in vitro и in vivo исследований инновационных лекарственных препаратов.

Программа реализуется на базе научного направления «Генная терапия» и «Биотехнология». 

Количество мест: 4

Форма обучения: очная

Срок обучения: 4 года

Что отличает Университет «Сириус»?

  • Возможность для всех аспирантов трудоустройства на должность младшего научного сотрудника с оплатой до 80 000 рублей
  • Наши аспиранты живут в гостиницах Олимпийской деревни.
  • Руководители научных направлений – ученые с мировым именем, профессора европейских университетов.
  • Возможность трудоустройства в ведущих компаниях страны.
  • Доступ к лабораториям с высокотехнологичным оборудованием. 

ВСТУПИТЕЛЬНЫЕ ИСПЫТАНИЯ: 

Программа вступительных испытаний

В рамках вступительных испытаний всем поступающим необходимо:

  • сдать письменный экзамен;
  • пройти устное собеседование.

КАК ПОСТУПИТЬ: 

Прием документов на обучение по программам аспирантуры будет проходить в два этапа.

Даты первого этапа: 1 марта – 23 июня 2024 года (18:00 по мск)

Даты второго этапа: 24 июня – 30 августа 2024 года (18:00 по мск)

Для участия в первом этапе необходимо подать заявление в личном кабинете абитуриента в срок до 23 июня 2024 года (18:00 по мск)

Приложить набор документов:

  • Паспорт
  • СНИЛС
  • Фото 3х4
  • Диплом с приложением (при отсутствии диплома на даты подачи заявления - справка из вуза, что Вы являетесь студентом последнего курса магистратуры/специалитета).
  • Подтверждение индивидуальных достижений (при наличии).

2.       Выгрузить сформированное системой заявление и согласие на обработку персональных данных, распечатать, подписать, фото/скан приложить в личный кабинет.

3. После проверки документов Приемной комиссией, необходимо зайти в личный кабинет абитуриента и выбрать удобную дату для прохождения письменного экзамена из предложенных;

4. В случае успешного прохождения письменного экзамена (40 баллов и более), вас пригласят на собеседование, с датами собеседований можно ознакомиться в личном кабинете и правилах приёма.

5. В случае успешного прохождения вступительных испытаний подать согласие на зачисление и оригиналы документов до 29 июля 2024 года включительно.

6. Ознакомиться со списками зачисленных первого этапа: 1 августа 2024 года.

Для участия во втором этапе: подать заявление в личном кабинете в срок до 30 августа (18:00 мск) 2024 года.

1. Приложить набор документов;

2. Выбрать даты вступительных испытаний.

3. Написать письменный экзамен и пройти собеседование.

4. В случае успешного прохождения вступительных испытания подать согласие на зачисление и оригиналы документов: до 18 сентября (18:00 мск) 2024 года.

5. Ознакомиться со списками зачисленных второго этапа на сайте: 23 сентября 2024 года.

Правила приема на обучение по программам подготовки научных и научно-педагогических кадров в аспирантуре в 2024/2025 учебном году

Программа вступительных испытаний

Квалификация/направление:  Научная специальность

Подать заявку:  http://lka.siriusuniversity.ru/

Руководитель:  Александр Владимирович Карабельский

Ссылка на кнопке "Подать заявку":  lka.siriusuniversity.ru/

Ссылка на кнопке "Узнать больше":  /pre-admission/

ТЕМЫ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ: 

1) «Создание моделей наследственных заболеваний сетчатки глаза человека на основе индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК)»

За последние несколько лет появилось значительное количество сообщений о получении ИПСК пациентов с различными заболеваниями. Модели на основе ИПСК позволяют изучать фенотипические особенности клеток, их метаболизм, потенциал к дифференцировке, а также оценивать эффективность и применимость генотерапевтических подходов для лечения, например, болезни Паркинсона, спинальной мышечной атрофии, мышечной дистрофии Дюшенна, оптических нейропатий, ретинопатий и многих других заболеваний.  
В ходе таких исследований можно изучать, как ведут себя в культуре сами ИПСК и полученные из них дифференцированные производные, а также использовать полученные клетки как микромодель заболевания для апробации in vitro новых генотерапевтических препаратов, созданных, например, на основе адено-ассоциированных вирусных векторов (AAV).  

В рамках научного проекта предполагается:

  • репрограммировать клетки кожи или крови пациентов с заболеваниями сетчатки в ИПСК;
  • охарактеризовать полученные ИПСК;
  • наработать, охарактеризовать и провести трансдукцию полученных ИПСК с помощью рекомбинантных AAV, несущих терапевтические гены;
  • провести дифференцировку полученных ИПСК в целевые дифференцированные клетки, создав модель заболевания;
  • охарактеризовать полученные дифференцированные производные;
  • оценить дифференцировочный потенциал больных и здоровых клеток;
  • проверить жизнеспособность дифференцированных производных клеток пациентов по сравнению с нормальными здоровыми клетками;
  • сравнить митохондриальный и свободно-радикальный статус здоровых и больных клеток, оценить клеточное дыхание полученных клеток, а также оценить способность AAV-векторов с терапевтическими генами восстанавливать здоровый фенотип клеток.

Научный руководитель: Гершович Юлия Геннадьевна – кандидат биологических наук, старший научный сотрудник направления «Генная терапия» Научно-технологического университета «Сириус», является автором более более15 научных работ, h-индекс – 8, клеточный биолог, специалист в части изучения и использования стволовых клеток, имеет опыт работы над проектами по тканевой инженерии в Университете Райса, а также биотехнологической компании ООО «Селлтера Фарм» (МБЦ Генериум).

2) «Изучение функциональной активности ко-шаперона AIPL1 при амаврозе Лебера»

Причиной возникновения амавроза Лебера (LCA) являются аутосомные рецессивные мутации в гене AIPL1, кодирующего шаперон фосфодиэстеразы PDE6. Нарушение функций PDE6 приводит к необратимым дегенеративным изменениям в зрительном нерве и слепоте. Некоторые мутации в AIPL1, связанные с LCA, влияют на функциональную активность белка и его способность связываться либо с фарнезилированными, либо с нефарнезилированными белками, в то время как другие мутации не влияют на взаимодействия белков, но приводят к неправильной сборке и нарушению модуляции уровней цГМФ PDE6. 

Задача данного проекта заключается в: (1) создании молекулярной модели взаимодействий AIPL1 с двумя типами белков, нефарнезилированными и фарнезилированными; (2) изучении эффекта патогенных мутаций в AIPL1 на эти взаимодействия; (3) использовании разработанной модели для подтверждения эффективности создаваемого геннотерапевтического препарата для лечения амавроза Лебера; и (4) использовании данной модели в качестве диагностического скрининга для изучения эффекта новых патогенных мутаций в AIPL1 и других белках комплекса фототрансдукции.

В рамках проекта будет проведен анализ субклеточной локализации и белок-белковых взаимодействий AIPL1 дикого типа (WT) в сравнении с вызывающими патологию вариантами AIPL1. 
WT AIPL1 и варианты AIPL1 будут совместно экспрессироваться либо с нефарнезилированными (NUB1, SUGT1, UBD, UBA6 и др.), либо с фарнезилированными (субъединицы PDE6, PDE5a и DNAJA2 и др.) белками.

Субклеточная локализация изучаемых белков будет оценена с помощью иммунофлуоресцентной конфокальной микроскопии. 
Белок-белковые взаимодействия будут подтверждены анализом NanoBRET (Promega), ко-иммунопреципитацией, вестерн-блоттингом, иммунофлуоресцентным анализом и ИФА, измеряющим степень модуляции цикла гидролиза цГМФ. 

Научный руководитель: Минская Екатерина Сергеевна – PhD, ведущий научный сотрудник направления «Генная терапия» Научно-технологического университета «Сириус», является автором более 20 научных работ, h-индекс 7, количество цитирований более 1000, работала в ведущих молекулярно-биологических и биохимических центрах Германии, Великобритании и Португалии по проектам в области создания моделей заболеваний, генетического редактирования, биоинженерии, иммунологии и вирусологии.

3) «Комбинированная иммунотерапия на основе онколитического VSV и CAR-T клеток для повышения эффективности лечения солидных опухолей»

Генетически модифицированные Т-клетки (CAR-T клетки), «вооруженые» против специфических антигенов опухолевых клеток, успешно используются для лечения лейкемии, но проявляют низкую клиническую эффективность при лечении солидных опухолей. Это обусловлено недостаточной миграцией Т-клеток в опухоль и наличием иммуносупрессивной среды. Рекомбинантные онколитические вирусы способны не только избирательно разрушать раковые клетки, но и доставлять в них хемокины для активации и привлечения Т клеток из крови в опухоли. Новый подход для повышения эффективности иммунотерапии солидных опухолей сочетает использование CAR-T клеток с онколитическими вирусами.

Данный проект направлен на тестирование уже произведенных в лаборатории рекомбинантных VSV, несущих хемокины, в сочетании с CAR-T клетками, таргетирующими различные виды солидных опухолей. Эффективность данного подхода будет оценена как in vitro на раковых клеточных линиях, так и in vivo.    

Научный руководитель: Минская Екатерина Сергеевна – PhD, ведущий научный сотрудник направления «Генная терапия» Научно-технологического университета «Сириус», является автором более 20 научных работ, h-индекс 7, количество цитирований более 1000, работала в ведущих молекулярно-биологических и биохимических центрах Германии, Великобритании и Португалии по проектам в области создания моделей заболеваний, генетического редактирования, биоинженерии, иммунологии и вирусологии.

4) «Направленная эволюция ортогональных пар aaRS/tRNA для повышения селективности и эффективность встройки ароматических неканонических аминокислот в полипептиды»
5) «Разработка методов включения метилаланина (Aib) в полипептиды биосинтезом»
6) «Получение ортогональных пар aaRS/tRNA для включение алифатических неканонических аминокислот в полипептиды биосинтезом»

Проект направлен на разработку ортогональных пар аминоацил-tRNA-синтетаза/tRNA (aaRS/tRNA) способных включать в белки и пептиды неканонические/непротеиногенные аминокислоты (НПА), т.е. те, которые не входят в список аминокислот, участвующих в рибосомальном синтезе белка. Кроме самих ортогональных пар будет получен штамм E. coli в котором один из кодонов может быть использован для встройки дополнительной аминокислоты. В результате реализации первой части проекта планируется создать универсальную платформу на базе клеток Escherichia coli для быстрой и экономически эффективной селекции ортогональных аминоацил-тРНК-синтетаз (ааRS), селективно распознающих новые неприродные/ непротеиногеные аминокислоты (НПА), а также для получения НПА-содержащих белков и пептидов.

Применение универсальной платформы планируется для создания лекарственных средств белковой и пептидной природы. Для создания лекарственных средств потребуется: подготовить дизайн и провести синтез белков и пептидов, оценить их функциональные и физико-химические свойства, осуществить оптимизацию веществ, провести in vivo исследования лидерных соединений, провести доклинические исследования кандидата. В ходе выполнения проекта будет разработан рекомбинантный белок GLP1/GIP агонист, несущий неканонические аминокислоты для разработки на его основе лекарственных препаратов.

Включение аминокислота метил аланина или Aminoisobutyric acid (Aib) в пептиды важно для разработки новых вариантов пептидов устойчивых к протеолитическому воздействию в крови. Однако до настоящего времени в литературе отсутствует упоминание ортогональных пар aaRS/tRNA способных включать Aib в пептиды и белки. В литературе упоминается возможность включения Aib в белки и пептиды, но не с помощью ортогональных пар, а в результате ошибочной встройки с использованием стандартных клеточных механизмов или с использованием химической перезарядки tRNA в бесклеточных системах. В связи с чем разработка ортогональных пар aaRS/tRNA способных включать Aib в пептиды и белки in vivo является важной задачей как с прикладной, так и фундаментальной точек зрения.

Научный руководитель: Алексей Сергеевич Розанов – кандидат биологических наук.

Узнать больше:  Да

Название:  Молекулярная биология

Картинка для анонса:  Загрузить

Детальное описание: 

Образовательная программа направлена на подготовку высококвалифицированных специалистов – исследователей и преподавателей с углубленными знаниями и практически применимыми навыками в области молекулярной биологии.  

Обучающиеся по научной специальности «Молекулярная биология» участвуют в научных исследованиях в области совершенствования технологий создания рекомбинантных вирусных векторов, создании прототипов биологических продуктов для лечения тяжелых хронических заболеваний с высоким потенциалом коммерциализации, разработке новых подходов к созданию лекарственных препаратов для медицинского и ветеринарного применения на основе рекомбинантных белков и малых молекул.

Научно-исследовательская деятельность направления сфокусирована на вопросах дизайна и оптимизации новых молекул, медицинской химии, in vitro и in vivo исследований инновационных лекарственных препаратов.

Программа реализуется на базе научного направления «Генная терапия» и «Биотехнология». 

Количество мест: 4

Форма обучения: очная

Срок обучения: 4 года

Что отличает Университет «Сириус»?

  • Возможность для всех аспирантов трудоустройства на должность младшего научного сотрудника с оплатой до 80 000 рублей
  • Наши аспиранты живут в гостиницах Олимпийской деревни.
  • Руководители научных направлений – ученые с мировым именем, профессора европейских университетов.
  • Возможность трудоустройства в ведущих компаниях страны.
  • Доступ к лабораториям с высокотехнологичным оборудованием. 

 Возврат к списку