Биоинформатика

Биоинформатика
Магистратура

Биоинформатика

06.04.01 Биология
09.04.03 Прикладная информатика

Биоинформатика является междисциплинарной областью, объединяющей общую и молекулярную биологию, генетику, химию, компьютерные науки, математику и статистику, и решающей крупномасштабные биологические проблемы, требующие анализа больших объёмов данных с вычислительной точки зрения. В связи с этим возникает необходимость подготовки кадров, владеющих междисциплинарными компетенциями в области наук о жизни, математики, статистики и программирования, а также способных разрабатывать и применять оригинальные алгоритмы и программные средства для обработки, анализа и интерпретации больших массивов биомедицинских и биотехнологических данных. 

Цель программы магистратуры «Биоинформатика» — подготовка высококвалифицированных специалистов, владеющих междисциплинарными компетенциями в области наук о жизни, математики, статистики и программирования, а также способных разрабатывать и применять оригинальные алгоритмы и программные средства для обработки, анализа и интерпретации больших массивов биомедицинских и биотехнологических данных. Наставниками студентов станут ученые направления «Вычислительная биология» Научного центра генетики и наук о жизни.

Записаться на онлайн-встречу с руководителем, педагогами и участниками программы


ВАЖНО! Вы можете подать документы в магистратуру Университета «Сириус», не дожидаясь получения диплома, — для этого достаточно приложить справку о том, что вы являетесь студентом. Ранняя подача заявки даёт вам возможность пройти пробный письменный экзамен и повысить свои шансы на поступление.

Видео:  Array

Выпускник программы будет готов к решению следующих профессиональных задач: 

  • разрабатывать инновационные вычислительные методы и программные средства, в том числе с использованием искусственного интеллекта, для обработки, анализа и интерпретации больших массивов биомедицинских и биотехнологических данных;
  • применять высокоэффективные методы обработки, анализа и интерпретации больших данных в биологии и медицине, а также в междисциплинарных исследованиях на стыке естественных наук;
  • формулировать и ставить научные и прикладные задачи в междисциплинарных исследованиях на стыке естественных наук для их решения методами вычислительной биологии;
  • обеспечивать внедрение результатов научной и проектной деятельности в практику.

Для вопросов о программе: 

Вопросы о программе можно задать специалисту-исследователю Куляшову М.А., kulyashov.ma@talantiuspeh.ru

КАК ПОСТУПИТЬ: 

Магистратура.jpg


Этап 1: подача документов

Даты: 3 марта – 25 июля (18:00 МСК)

  • Зарегистрироваться на сайте университета в личном кабинете абитуриента.
  • Подать заявление на участие в конкурсе на программы магистратуры (в заявлении можно указать до пяти программ).
  • Приложить к заявлению сканы документов:

– паспорт (2-3 стр., стр. с регистрацией);

– скан диплома бакалавра или специалиста, при отсутствии диплома – справку о том, что вы являетесь студентом выпускного курса;

– СНИЛС;

– фото 3х4;

– подтверждение индивидуальных достижений;

– резюме;

– выгрузить и распечатать сформированное системой заявление и согласие на обработку персональных данных, подписать и загрузить сканы обратно, оригиналы документов сохранить.

  • Нажать кнопку «Отправить документы в приемную комиссию».

Этап 2: вступительные испытания


Даты: 26 июля – 18 августа


После окончания приема документов вам необходимо пройти письменный экзамен. Для каждой программы предусмотрены свой письменный экзамен и собеседование.

Порядок написания письменного экзамена:

  • За день до экзамена в 17:00 (мск) пройдет техническая консультация.
  • Для экзамена вам понадобятся:
    • компьютер или ноутбук,
    • веб-камера, микрофон и динамики,
    • листы бумаги и пишущие принадлежности.
  • Рекомендуем использовать операционную систему Windows и браузеры Яндекс или Google Chrome, так как они наиболее совместимы с системой прокторинга.
  • Экзамен проходит под наблюдением проктора, который может оказать техническую поддержку при необходимости.
  • Если по итогам письменного экзамена вы набираете 20 баллов и более, вас пригласят на собеседование.

Порядок прохождения собеседования

  • Выбор времени: За несколько дней до собеседования с вами свяжется специалист приемной комиссии, и вы совместно выберете удобный временной слот.
  • Продолжительность: Собеседование длится около 20 минут.
  • Презентация: Участнику необходимо подготовить презентацию, которая будет демонстрироваться через демонстрацию экрана.
  • Результат: Если по итогам собеседования вы набираете 20 баллов и более, то попадаете в конкурсный список.

Этап 3: зачисление


Даты: 19 - 25 августа

  • Поступающие приглашаются в порядке конкурсного списка, который формируется на основе суммы баллов за:
    • Письменный экзамен
    • Собеседование
    • Индивидуальные достижения
  • Приглашенным к поступлению участникам будет направлен перечень документов, необходимых для отправки в университет (включая оригинал диплома, возможно курьерской службой).
  • Если поступивший предоставляет оригинал диплома и согласие в срок до 25 августа, он включается в приказ о зачислении.

КАК СВЯЗАТЬСЯ С ПРИЕМНОЙ КОМИССИЕЙ: 

Официальный канал Приемной комиссии в Telegram

Вопросы о программе можно задать специалисту-исследователю Куляшову М.А., kulyashov.ma@talantiuspeh.ru

Карьерные возможности после обучения: 

Выпускники смогут построить карьеру в коммерческих компаниях БИОКАД, «Сербалаб», «Иннопрактика», «Геномед», а также в качестве аспирантов, научных сотрудников-биоинформатиков или системных биологов, руководителей научных групп или отделений R&D в научно-образовательных учреждениях: ведущих вузах Российсской Федерации, институтах РАН, Минздраве РФ.

Квалификация/направление:  НАПРАВЛЕНИЕ ПОДГОТОВКИ

Ключевые дисциплины (модули) программы: 

  • Обработка данных NGS.
  • Основные алгоритмы машинного обучения.
  • Нейронные сети в биоинформатике.
  • Алгоритмы в биоинформатике.
  • Системная биология.
  • Структурная биоинформатика и строение белков.
  • Компьютерная разработка лекарственных средств и основы хемоинформатики.

Название для шапки:  Биоинформатика

О ПРОГРАММЕ: 

Уникальность образовательной программы


Программа магистратуры выступает точкой роста для подготовки и развития биоинформатики и системной биологии в Российской Федерации, а также, учитывая уникальную материально-техническую базу Университета, создаёт возможности для наиболее эффективного развития научно-исследовательских и прикладных проектов обучающихся. 

Преимущество программы заключается:

  • в глубокой междисциплинарной подготовке обучающихся в области молекулярной биологии, генетики, химии, компьютерных наук, математики и статистики;
  • в единстве научно-исследовательской и прикладной подготовки обучающихся, реализующемся посредством формирования у обучающихся не только навыков разработки различных компьютерных методов работы с данными, но и практических навыков работы с биомедицинскими и биотехнологическими данными (от получения в лабораторных условиях до их обработки, анализа и интерпретации) в широком спектре задач наук о жизни;
  • в возможности формирования обучающимися индивидуальной образовательной траектории за счёт выбора блока профессиональных дисциплин (модулей) по следующим направлениям: анализ геномных данных, структурная биология и разработка лекарственных препаратов;
  • в сквозной практической и научно-исследовательской (проектно-исследовательской) деятельности обучающихся над задачами Научного центра генетики и наук о жизни Университета, Научного центра трансляционной медицины Университета и технологических компаний — партнёров программы магистратуры с использованием многоядерного вычислительного кластера и высокотехнологичного оборудования Ресурсного центра естественных наук Лабораторного комплекса Университета.



ПАРТНЕРЫ:  МГУ / ПЕРВЫЙ МГМУ ИМ. И.М. СЕЧЕНОВА / Институт общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН / КУРЧАТОВСКИЙ ИНСТИТУТ / GENERIUM / BIOCAD

Период обучения:  2 года

Порядок прохождения собеседования: 

  1. Выбор времени: За несколько дней до собеседования с вами свяжется специалист приемной комиссии, и вы совместно выберете удобный временной слот.
  2. Продолжительность: Собеседование длится около 20 минут.
  3. Презентация: Участнику необходимо подготовить презентацию, которая будет демонстрироваться через демонстрацию экрана.
  4. Результат: Если по итогам собеседования вы набираете 20 баллов и более, то попадаете в конкурсный список.

Примерная тематика выпускных квалификационных работ: 

  • Динамическое моделирование метаболизма метанотрофных микроорганизмов.
  • Математическое моделирование микробного сообщества молочнокислых бактерий в различных условиях.
  • Изучение особенностей метаболизма Metylotuvimicrobium alcaliphilum 20ZR при культивировании на метаноле в качестве единственного источника углерода с использованием методов потокового моделирования
  • Разработка модуля для реконструкции потоковых математических моделей с использованием методов машинного обучения.
  • Реконструкция потоковых dFBA моделей для спутников M.Capsulatus Bath: Cupriavidus gilardii, Cupriavidus necator, Brevibacillus agri.
  • Разработка методов предсказания геномных энхансеров по омиксным данным экспериментов кэп-анализа генной экспрессии (CAGE), на основе подхода скрытых марковских цепей.
  • Разработка Interaction Fingerprint (IFP) для анализа белок-лигандных взаимодействий и диффузной генерации новых лекарственных соединений.
  • Разработка ML коллективных переменных в QM/MM метадинамике для протеиназ разных типов для рационального дизайна новых ферментов.

РЕЗУЛЬТАТЫ ОБУЧЕНИЯ: 

Выпускник программы магистратуры будет готов к решению следующих профессиональных задач:

  • разрабатывать инновационные вычислительные методы и программные средства, в том числе с использованием искусственного интеллекта, для обработки, анализа и интерпретации больших массивов биомедицинских и биотехнологических данных;
  • применять высокоэффективные методы обработки, анализа и интерпретации больших данных в биологии и медицине, а также в междисциплинарных исследованиях на стыке естественных наук;
  • формулировать и ставить научные и прикладные задачи в междисциплинарных исследованиях на стыке естественных наук для их решения методами вычислительной биологии;
  • обеспечивать внедрение результатов научной и проектной деятельности в практику.

Выпускники смогут построить карьеру в коммерческих компаниях БИОКАД, «Сербалаб», «Иннопрактика», «Геномед», а также в качестве аспирантов, научных сотрудников-биоинформатиков или системных биологов, руководителей научных групп или отделений R&D в научно-образовательных учреждениях: ведущих вузах Российсской Федерации, институтах РАН, Минздраве РФ.

Руководитель:  Илья Ринатович Акбердин

Ссылка на кнопке "Подать заявку":  https://lka.siriusuniversity.ru/application/filing

Ссылка на кнопке "Узнать больше":  /pre-admission/

ТЕМЫ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ: 

Примерная тематика выпускных квалификационных работ


  • Динамическое моделирование метаболизма метанотрофных микроорганизмов.
  • Математическое моделирование микробного сообщества молочнокислых бактерий в различных условиях.
  • Изучение особенностей метаболизма Metylotuvimicrobium alcaliphilum 20ZR при культивировании на метаноле в качестве единственного источника углерода с использованием методов потокового моделирования
  • Разработка модуля для реконструкции потоковых математических моделей с использованием методов машинного обучения.
  • Реконструкция потоковых dFBA моделей для спутников M.Capsulatus Bath: Cupriavidus gilardii, Cupriavidus necator, Brevibacillus agri.
  • Разработка методов предсказания геномных энхансеров по омиксным данным экспериментов кэп-анализа генной экспрессии (CAGE), на основе подхода скрытых марковских цепей.
  • Разработка Interaction Fingerprint (IFP) для анализа белок-лигандных взаимодействий и диффузной генерации новых лекарственных соединений.
  • Разработка ML коллективных переменных в QM/MM метадинамике для протеиназ разных типов для рационального дизайна новых ферментов.


Узнать больше:  Да

Уникальность образовательной программы: 

Программа магистратуры выступает точкой роста для подготовки и развития биоинформатики и системной биологии в Российской Федерации, а также, учитывая уникальную материально-техническую базу Университета, создаёт возможности для наиболее эффективного развития научно-исследовательских и прикладных проектов обучающихся. 


Преимущество программы заключается:

  • в глубокой междисциплинарной подготовке обучающихся в области молекулярной биологии, генетики, химии, компьютерных наук, математики и статистики;
  • в единстве научно-исследовательской и прикладной подготовки обучающихся, реализующемся посредством формирования у обучающихся не только навыков разработки различных компьютерных методов работы с данными, но и практических навыков работы с биомедицинскими и биотехнологическими данными (от получения в лабораторных условиях до их обработки, анализа и интерпретации) в широком спектре задач наук о жизни;
  • в возможности формирования обучающимися индивидуальной образовательной траектории за счёт выбора блока профессиональных дисциплин (модулей) по следующим направлениям: анализ геномных данных, структурная биология и разработка лекарственных препаратов;
  • в сквозной практической и научно-исследовательской (проектно-исследовательской) деятельности обучающихся над задачами Научного центра генетики и наук о жизни Университета, Научного центра трансляционной медицины Университета и технологических компаний — партнёров программы магистратуры с использованием многоядерного вычислительного кластера и высокотехнологичного оборудования Ресурсного центра естественных наук Лабораторного комплекса Университета.

УЧЕБНЫЙ ПЛАН: 

Ключевые дисциплины (модули) программы


  • Обработка данных NGS.
  • Основные алгоритмы машинного обучения.
  • Нейронные сети в биоинформатике.
  • Алгоритмы в биоинформатике.
  • Системная биология.
  • Структурная биоинформатика и строение белков.
  • Компьютерная разработка лекарственных средств и основы хемоинформатики.


Форма обучения:  очная

Этап 1: подача документов: 

Даты: 3 марта – 25 июля 18:00 МСК

  1. Зарегистрироваться на сайте университета в личном кабинете абитуриента.
  2. Подать заявление на участие в конкурсе на программы магистратуры (в заявлении можно указать до пяти программ)
  3. Приложить к заявлению сканы документов:
    • Паспорт (2-3 стр, стр. с регистрацией);
    • Скан диплома бакалавра или специалиста, при отсутствии диплома –справку о том, что Вы являетесь студентом выпускного курса;
    • СНИЛС;
    • Фото 3х4;
    • Подтверждение индивидуальных достижений;
    • Резюме;
    • Выгрузить и распечатать сформированное системой заявление и согласие на обработку персональных данных, подписать и загрузить сканы обратно, оригиналы документов сохранить.
  4. Направить документы в приемную комиссию

Этап 2: вступительные испытания: 

Даты: 26 июля – 18 августа


После окончания приема документов вам необходимо пройти письменный экзамен. Для каждой программы предусмотрены свой письменный экзамен и собеседование.

Порядок написания письменного экзамена:

  1. За день до экзамена в 17:00 (мск) пройдет техническая консультация
  2. Для экзамена вам понадобятся:
    • Компьютер или ноутбук,
    • Веб-камера, микрофон и динамики,
    • Листы бумаги и пишущие принадлежности.
  3. Рекомендуем использовать операционную систему Windows и браузеры Яндекс или Google Chrome, так как они наиболее совместимы с системой прокторинга.
  4. Экзамен проходит под наблюдением проктора, который может оказать техническую поддержку при необходимости.
  5. Если по итогам письменного экзамена вы набираете 20 баллов и более, вас пригласят на собеседование.

Этап 3: зачисление: 

Даты: 19 - 25 августа;

  1. Поступающие приглашаются в порядке конкурсного списка, который формируется на основе суммы баллов за:
    • Письменный экзамен
    • Собеседование
    • Индивидуальные достижения
  2. Приглашенным к поступлению участникам будет направлен перечень документов, необходимых для отправки в университет (включая оригинал диплома, возможно курьерской службой).
  3. Если поступивший предоставляет оригинал диплома и согласие в срок до 25 августа, он включается в приказ о зачислении.

Фото рядом с "Как связаться с приемной комиссией":  Загрузить

Верхнее фото:  Загрузить

Уникальность образовательной программы фото:  Загрузить

Этап 1: подача документов фото:  Загрузить

Этап 2: вступительные испытания фото:  Загрузить

Этап 3: зачисление фото:  Загрузить

Выпускник программы будет готов к решению следующих профессиональных задач фото:  Загрузить

Карьерные возможности после обучения фото:  Загрузить

Ключевые дисциплины (модули) программы фото:  Загрузить

Места прохождения практик и стажировок фото:  Загрузить

Примерная тематика выпускных квалификационных работ фото:  Загрузить

Видео ВКонтакте обложка и ссылка:  Загрузить / Загрузить

Название:  Биоинформатика

Картинка для анонса:  Загрузить

Детальное описание: 

Биоинформатика является междисциплинарной областью, объединяющей общую и молекулярную биологию, генетику, химию, компьютерные науки, математику и статистику, и решающей крупномасштабные биологические проблемы, требующие анализа больших объёмов данных с вычислительной точки зрения. В связи с этим возникает необходимость подготовки кадров, владеющих междисциплинарными компетенциями в области наук о жизни, математики, статистики и программирования, а также способных разрабатывать и применять оригинальные алгоритмы и программные средства для обработки, анализа и интерпретации больших массивов биомедицинских и биотехнологических данных. 

Цель программы магистратуры «Биоинформатика» — подготовка высококвалифицированных специалистов, владеющих междисциплинарными компетенциями в области наук о жизни, математики, статистики и программирования, а также способных разрабатывать и применять оригинальные алгоритмы и программные средства для обработки, анализа и интерпретации больших массивов биомедицинских и биотехнологических данных. Наставниками студентов станут ученые направления «Вычислительная биология» Научного центра генетики и наук о жизни.

Записаться на онлайн-встречу с руководителем, педагогами и участниками программы


ВАЖНО! Вы можете подать документы в магистратуру Университета «Сириус», не дожидаясь получения диплома, — для этого достаточно приложить справку о том, что вы являетесь студентом. Ранняя подача заявки даёт вам возможность пройти пробный письменный экзамен и повысить свои шансы на поступление.

Детальная картинка:  Загрузить